九州付近は太平洋高気圧の周辺部となり、弱い熱帯低気圧が日本海西部を北東に進んだ。 このため九州北部付近は大気の状態が非常に不安定であった。

【降雨の状況】
22 日夜、九州北部地方にあった雨雲は長崎県北部からゆっくり南下して、23 日明け方までに平戸・松浦・国見山・佐世保で１時間に30 ミリ以上の雨を降らせている。
一方、諫早付近では 23 日02 時頃から雨雲が発達し始め、05 時までの１時間で36 ミリの雨を降らせている。
その後長崎県北部から南下してきた雨雲は諫早付近の雨雲と合流し、23 日08 時から11 時頃まで諫早付近に停滞し大雨を降らせた。
諫早では10 時までの１時間に101 ミリの大雨が降り、観測統計開始以来の最大値を観測した。さらに11 時までの１時間に93 ミリの降水量を観測した。