大東諸島には、南大東島、北大東島と沖大東島があります。 沖縄本島の東方約360kmにあるのが南大東島で、この南大東島から約8km北に北大東島、そして約150km南に沖大東島があります。
　大東諸島は、琉球列島の並びからは大きく飛び離れた小さな島々です。 ３つの島の中で一番大きい南大東島でも、面積は30.57平方キロメートルに過ぎません。 また大東諸島は、周囲を深さ2000メートルもある海に囲まれていて、独立峰のような孤島になっています。
　大東諸島は、珊瑚環礁が隆起して島が形成されて、有人島の南北大東島では中央部は盆地のように窪んで沼や湿地が散在しています。 この盆地の周囲を、屏風のように小高い丘が取り囲んでいます。そして、丘の上の木々が防風林として台風などの災害から住民を守っています。

　南大東島の年間降水量の平年値は、約1639ミリです。他の沖縄地方では、おおむね2000ミリ以上ありますので、比較的少ないといえます。
　５～６月にかけての梅雨期と７～１０月にかけての台風期に最も降水が多く、この半年間で年間降水量の約60％を占めています。 しかし、年間を通して平均的に降水があることも特徴となっています。大雨による災害は、主に台風の通過や、梅雨期の停滞前線による強雨によってもたらされています。