9月13日に小笠原近海で発生した台風第18号は、日本の南海上を北上し、大型の勢力を保ったまま16日8時前に愛知県豊橋市付近に上陸した後、本州中部を北東に進んだ。この台風を取り巻く雨雲や湿った空気が次々と流れ込んだため、京都府では記録的な大雨となった。 このため、16日5時05分に京都府に大雨特別警報を発表した。降り始めの9月15日0時から16日12時までの総雨量は、綾部市睦寄町で353.5mm、南丹市美山で318.5mm、京都市京北で313.0mm、南丹市園部で311.5mm、舞鶴で305.0mmを観測するなど各地で記録的な大雨となった。
この台風の影響で、京都府では軽傷者が3名出た。また、住宅の一部損壊が7戸、床上浸水が723戸、床下浸水が2197戸の被害が発生した（京都府災害対策本部調べ：9月16日20時00分現在）