大雨は主に前線や低気圧などによって発生します。宮古島地方では、1988年（昭和63）4月28日に多良間島で1時間降水量152㎜、3時間降水量383㎜の非常に激しい雨を観測しています。宮古島地方では過去に大雨により、がけ崩れや家屋への浸水などが発生しています。 畑の土が押し流されたり、畑地・道路への冠水などの被害は毎年のように発生しています。一方、大きな川がないため他地域に見られるような大規模な洪水は発生していませんが、過去には、市街地で整備された排水路付近で遊んでいた中学生が増水した水路に落ち、地下の水路を数百メートル押し流される事故が発生しています。